오염퇴적물에 존재하고 있는 오염물질을 제거하는 방법으로 다양한 물리·화학적인 방법들이 소개되어 적용되어져 왔다. 하지만 물리·화학적인 정화방법의 대안으로 미생물과 같은 생물촉매를 이용한 정화방법이 최근 주목 받고 있다. 과거에는 미생물에 의한 오염물질의 제거가 매우 느리고 효율이 낮아 실용적이지 못한 방법으로 여겨졌으나 최근 오염물질 제거에 높은 효율을 보이는 다양한 미생물 종에 대한 연구가 활발히 이루어지고 있어 향후 오염퇴적물 정화에 있어서 미생물을 이용한 생물학적 처리의 역할은 확대될 것으로 전망된다. 본 자료에서는 기존 연구 사례를 중심으로 중금속류 및 유기오염물질 제거에 우수한 효율을 보이는 미생물들을 소개하고 분해 및 제거 메커니즘에 대하여 기술하였다.