학회 | 한국화학공학회 |
학술대회 | 2007년 봄 (04/19 ~ 04/20, 울산 롯데호텔) |
권호 | 13권 1호, p.368 |
발표분야 | 생물화공 |
제목 | Precise expression analysis of Haematococcus pluvialis for astaxanthin production using CE-SSCP |
초록 | Astaxanthin은 carotenoid의 일종으로 식용색소, 양식 사료 첨가물 등으로 활용되며, 강력한 항산화력 때문에 보조 식품으로 사용되기도 한다. Astaxanthin을 생합성하는 주요한 원천은 Haematocuccus pluvialis라는 green microalgae이다. H. pluvialis는 강한 환경적 자극이 주어졌을 때, astaxanthin등의 carotenoid 들을 축적하여 붉은 빛을 띄는 cyst cell로 변화한다. 본 연구에서는 각기 다른 시점에서 샘플링한 H. pluvialis cell에서 7개의 유전자의 발현량이 어떻게 변화하는지를 CE-SSCP를 통하여 분석하였다. 염기 서열이 확보된 7개의 유전자에 대해 각각의 서열에 대한 특이적인 결합을 하는 primer 쌍을 MPrime으로 디자인 하였다. 각 유전자를 디자인 된 primer로 증폭하여, 증폭이 exponential하게 이루어지는 cycle을 샘플링을 통해 확인하였고, 이 cycle에서 유전자를 CE-SSCP를 통해 정확하게 정량할 수 있었다. 본 연구를 통하여 염기 서열이 확보된 유전자에 대해서 유전자의 발현분석을 빠르고 정확하게 할 수 있는 방법을 확립하였다. 유전자의 발현량에 민감하게 반응하는 산물의 경우 기존의 DNA microarray를 통한 data로는 한계가 있기 때문에 절대 정량까지 가능한 분석방법을 요한다. 본 연구결과는 CE-SSCP를 이용한 발현분석법이 DNA microarray 에서 얻어진 high-throughput data를 경제적이고 효율적으로 검증할 수 있는 기술임을 보여준다. |
저자 | 신기원, 박영섭, 이민영, 황대희, 정규열 |
소속 | 포항공과대 |
키워드 | CE-SSCP; astaxanthin; Haematococcus pluvialis; expression analysis |
원문파일 | 초록 보기 |